《卧底》是一部张力十足的国产警匪缉毒剧。故事围绕我方三名最得力的军校优秀学生——达子、大陆与毛乐展开。在上级赵天义的派遣下，三人前赴金三角执行渗透两大贩毒集团的卧底任务。然而，危机暗伏的魔窟让局势迅速失控：毛乐身份暴露惨遭不测，达子与大陆被迫在生死边缘独自周旋。达子潜伏于大毒枭华仔的制毒集团，却意外身份败露。生死存亡之际，他被迫手刃掌握新型毒品配方的制毒师，自己也由此成为金三角唯一掌握配方的人。华仔不仅未杀他，反而以重金结纳，甚至逼迫达子斩断后路，与其结拜为兄弟。从此，达子深陷泥潭，与上级组织彻底失联，被外界误判为铁心从匪的叛徒。为查明真相，赵天义痛心激活潜伏于另一大毒枭豪哥集团的大陆。大陆曾在枪口下舍命救下豪哥，不仅借此取得信任，更迎娶其妹艾米，接手家族核心生意。与此同时，与他一同越狱的憨厚同袍阿金，竟是缅甸警方安插的卧底。两名卧底互不相识，却在险境中结下深厚羁绊。当大陆接到铲除“叛徒”达子的最终指令时，他在最后一刻洞察了达子良心未泯的真相。两位身处黑暗深渊的孤胆英雄，决定联手救赎。他们将用生命为曾经的过错补过，在险象环生的毒窟中，为彻底捣毁新型贩毒基地献出一切……