为了培育各领域的超一流高中生，政府设立了公认的特权学园——「私立希望之峰学园」。这所学园云集了拥有“超高校级”才能的“本科”生，同时也容纳了只要支付高额学费便能入学的“预备学科”学生。 在“超高校级的绝望”所引发的“人类史上最大最恶的绝望事件”影响下，世界陷入了濒临崩坏的绝境。为了拯救这个充满绝望的世界，原希望之峰学园的校长与师生们集结成立了“未来机关”。其中，曾打倒江之岛盾子的苗木诚等第78期生也加入其中，持续进行着世界复兴的活动。然而，苗木诚却因被指控“庇护绝望的残党”而遭到众人的怀疑。 当未来机关众人为了处分苗木诚而聚集一堂时，却遭到了黑白熊的监禁，并被强迫进行“最后的自相残杀”。他们的手臂被戴上了奇妙的手环，一定时间后就会被注入安眠药。不仅如此，众人中还潜伏着为了抹杀未来机关而来的“背叛者”。 “为了生存下去，非得找出背叛者并杀掉不可。”这是一场不存在“学级裁判”规则的自相残杀。杀或者被杀，在这极限状态的死亡游戏中，苗木诚等人被逼入绝境。 希望杀死希望的绝望物语，就此拉开帷幕。