《青天衙门Ⅱ》由《将军之爱》、《望子成龙》、《审妻记》、《花轿奇谋》四个单元故事组成。在一个旱雷闷响的夜晚，顺天府衙外传来阵阵凄厉的喊冤声。一名泪流满面、悲恸欲绝的书童手持鼓棒，正拼命击鼓鸣冤。时任顺天府尹的谭振英闻讯，立刻率领衙役出门查看，并连夜开堂审问原委。书童方庆被带到公堂之上，泣诉了少爷方之栋与余清莲的悲惨遭遇。两人本是一对青梅竹马的恋人，奈何造化弄人，清莲被迫流落风尘，沦为暖香居的卖艺女子。为了给清莲赎身，方之栋在街头辛苦卖字画攒钱。皇天不负有心人，之栋不仅将一支金钗送予清莲作为定情信物，更将辛苦攒下的五百两银子交到暖香居嬷嬷手中，终为清莲赎回了自由身。本应是有情人终成眷属的圆满结局，奈何天不遂人愿。就在之栋与清莲的新婚大喜之日，对清莲早已垂涎已久的富察家后人富察家康，竟带人强行闯入方家大肆捣毁礼堂。家康不仅将上前理论的书童方庆打昏，痛殴上前阻拦斥责的方之栋，更强行奸辱了余清莲，随后扬长而去。清莲遭此大辱，自感玷污了方家门风，含冤割腕自尽。之栋眼见清莲血流满地，悲痛至极，亦决意殉情随清莲而去。方家二老悲痛欲绝，欲状告富察家康，然而县令因惧怕得罪九门提督，不但不予受理，反而屈打方家二老。二老深感控诉无门，为防止顺天府尹与县令官官相护、包庇富察家康，两人最终决意以死相谏，只求以此查明这段沉冤……