《复仇者联盟》以及随后影响深远的纽约之战，让外星人与超能力者的存在不再是坊间传说的秘密。战后，世界格局即将重新洗牌，野心家们蠢蠢欲动，肩负守护人类重任的神盾局（S.H.I.E.L.D.）正面临着前所未有的严峻挑战。　　在此危急关头，一度传闻死于纽约之战的特工菲尔·科尔森（克拉克·格雷格 Clark Gregg 饰）在局长尼克·弗瑞的暗中运作下奇迹“复活”。他重返神盾局，奉命组建一支精锐的独立机动特工小组，专责调查那些全新的、陌生的、未知的超自然与机密事件。　　科尔森吸纳了身怀绝技的精英探员：黑客专家格兰特·沃德（布雷特·道顿 Brett Dalton 饰）、身手不凡的“骑兵”梅琳达·梅（温明娜 Ming-Na Wen 饰）、天才物理与工程专家莱奥·菲兹（伊恩·德·卡兹泰克 Iain De Caestecker 饰）、生物与化学专家盖玛·西蒙斯（伊丽莎白·亨斯屈奇 Elizabeth Henstridge 饰），以及来自黑客民间团体“涨潮”组织的神秘女孩斯凯（科洛·本内特 Chloe Bennet 饰）。　　这支小队以一己凡人之躯，投入到各种匪夷所思且疑云重重的危险事件中。在充满超级英雄、外星人、未知物质与黑暗势力（如“蜈蚣”组织）的世界里，他们从最初的分歧不断，逐渐磨合为一支充满默契与信任的团队。他们将以行动证明，即便是一群没有超能力的普通人，只要团结一心，也拥有足以改变世界的力量；但在执行任务期间，科尔森开始对自己复活的经历产生质疑，而那背后隐藏的惊人真相（T.A.H.I.T.I.计划），正等待着他去揭开……