《神探狄仁杰3》由《凉州案-黑衣社》与《邗沟案-漕渠魅影》两个惊险绝伦、触目惊心的故事组成。故事承接第二部，狄仁杰（梁冠华 饰）自连破幽州、并州、蛇灵、江州等一系列大案后，几经恳请，终于得武皇（吕中 饰）允准回老家并州休养。他本想在归乡途中绕道凉州，看望门生曾泰并辞别，期盼着回乡后能远离朝堂纷争，专心务农、垂钓汾水。然而，正如护卫李元芳（张子健 饰）所言，这看似颐养天年的平静中，却蕴藏着更大的杀机与阴谋。在《凉州案-黑衣社》中，武周年间正值盛世，然边事频仍，连年征战致使军中缺饷，守边将士军心不稳。此时，狄仁杰正带领李元芳与四大军头蜿蜒在去往凉州的山道中，一场生死迷局正等待着他。在《邗沟案-漕渠魅影》中，雷鸣电闪，大雨如注，大运河长江通往淮水的邗沟水面波涛汹涌。狂风暴雨之中，江淮盐铁转运使的运盐官船在此覆没——一年之内已是第十五次，数百运卒丧生，数百万石食盐没于水中。朝廷派去查察的官员均无功而返，水部郎中李翰竟在任上离奇自缢。由于盐运受阻，扬州西北各地已爆发盐荒。武则天急召狄仁杰进宫，任其为江南道黜置大使兼江淮都转运使，彻查邗沟覆船大案。狄公遂带领李元芳、曾泰火速赶赴扬州。本部历史侦探悬疑系列电视剧《神探狄仁杰》，不仅将扑朔迷离的悬疑剧情与惊悚的视觉元素融为一体，更加入了李元芳与狄如燕的爱情、狄仁杰与曾泰的师生之情，以及武则天与狄仁杰的君臣际遇等情感戏码，使得本系列在惊险刺激的段段奇案中，增添了不少触动人心的温情色彩。