《十二猴子》第三季将采用一种极其罕见的档期模式震撼播出：自5月19日起至5月21日，仅用三天时间连播全部10集（首日连播4集，随后每日3集）。本剧已提前获得第四季续订，而第四季也将作为整部剧集的最终章，为这场跨越时空的宏大史诗画上句号。 3×01《Mother》：在2163年满目疮痍的世界末日中，Cole不顾一切地四处寻找神秘之城“Titan”。与此同时，不幸被捕的Railly面临被迫做出艰难抉择的绝境。另一边，十二猴子军正虔诚地等待着“见证者”的降临。 3×02《Guardians》：Cole与Jones穿越至第一次世界大战结束后的法国，去寻找Jennifer Goines的踪迹。然而在那里，他们遭遇了一个极其危险的时间旅行团队——“守护者”。 3×03《Enemy》：Ramse带着一名被俘的宿敌返回基地，团队间信任的根基面临严峻考验。为了探寻被掩盖的真相，Cole和Jones究竟会做出怎样惊人的举动？ 3×04《Brothers》：Ramse与Cole鼓起勇气重返2007年。他们深知此行要么是致命的陷阱，要么就是杀死“见证者”的最后机会。但当Cole揭开一个令人心碎的真相后，他才意识到这场任务既是陷阱，也是终极的猎杀。 3×05《Casualty》：众人急需解开谜团，但留给他们的时间已然不多。Jennifer与Deacon前往1989年，试图盗窃一份神圣的宗教文件。与此同时，Railly和Cole竭力隐瞒一个秘密，当这秘密濒临曝光的边缘，他们将如何应对？ 3×06《Nature》：时间回溯至1953年，Cole和Railly与Gale在十二猴子军诞生的前夕意外重逢。本集还将由克里斯托弗·洛伊德客串出演一位标志性反派角色的父亲。 3×07《Nurture》：Cole和Railly必须做出一个难以言喻的痛苦决定，但两人的选择却截然相反。Railly向一位并不靠谱的朋友寻求建议，而Jones的疑心也日益加重。在一场激烈的大战之中，大混乱终究还是降临了。 3×08《Masks》：朋友与宿敌齐聚维多利亚时代的伦敦，静候“见证者”的到来。Cole与Railly穿梭于时间长河之中，展开了一场争分夺秒的追踪行动。 3×09《Thief》：Cole和Railly终于拼凑出线索，得知了那个自称“见证者”的男人背后令人心碎的生活往事。 3×10《Witness》：所有的剧情线索最终都汇聚到了Railly和Cole身上。Titan的阴影不断逼近，昔日的盟友被迫自相残杀，而“见证者”终于站到了命运抉择的入口。