宋莲生乃一江湖郎中，虽浪荡不羁却医术高超。在长沙行医期间，他巧遇绣庄庄主无双，被其深深吸引，遂在绣庄门前开起门诊。因应允无双之请，帮助东林党购置大量伤药，宋莲生触犯朝廷禁令面临死罪，幸得九芝堂老板妙计营救方才脱险。此后，他因前事与地痞齐大头结怨，又抢救了闻世堂束手无策的病人，致使闻世堂名声大跌并遭其仇视。更因误会无双，宋莲生黯然离开长沙。途中，他偶然发现外地闹瘟疫，且疫症即将蔓延至长沙，即刻返回通知九芝堂大量购药并控制药材销售，终使瘟疫得以控制。圣上欲赐堂号给立功药房，闻世堂吴老太医的侄女如月却使出暗招，令九芝堂名声受损。恰逢九芝堂药材短缺且无双身患重病，宋莲生无奈只得向闻世堂求助，如月又施毒计令宋莲生被逐出长沙，无双亦带着支离破碎的心前往南京……宋莲生生性善良、好打抱不平，却在长沙被迫几度离返，真可谓世事难料，人心叵测。
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